Neutralisatie Ontsnapping door SARS-CoV-2 Omicron Subvarianten BA.2.12.1, BA.4 en BA.5

Aan de redactie:

Omicron-subvariante mutaties en neutraliserende antilichaamreacties.

Paneel A toont de afstamming van mutaties die zijn geïdentificeerd in de omicron BA.1, BA.2, BA.2.12.1 en BA.4 of BA.5 subvarianten van SARS-CoV-2, in vergelijking met de referentie WA1 /2020 isoleren. BA.4 en BA.5 hebben identieke sequenties van het spike-eiwit en zijn dus bij elkaar gegroepeerd. FP staat voor fusiepeptide, HR1 heptad repeat 1, HR2 heptad repeat 2, NTD N-terminaal domein, RBD-receptorbindend domein, RBM-receptorbindend motief, SD1-subdomein 1 en SD2-subdomein 2. Paneel B toont neutraliserende antilichaamtiters zoals bepaald door op luciferase gebaseerde pseudovirusneutralisatie-assays in monsters verkregen van 27 deelnemers 6 maanden na ontvangst van de BNT162b2-boodschapper-RNA-vaccinreeks met twee doses en 2 weken na de derde (booster) dosis. Paneel C toont neutraliserende antilichaamtiters bij deelnemers die waren geïnfecteerd met de BA.1- of BA.2-subvariant. Alle geïnfecteerde deelnemers waren gevaccineerd, behalve 1 deelnemer die een negatieve neutraliserende antilichaamtiter had. Bij 9 deelnemers worden twee of drie tijdstippen na infectie getoond. Neutraliserende antilichaamtiters werden gemeten tegen het SARS-CoV-2-referentie-isolaat WA1/2020 en de omicron-subvarianten BA.1, BA.2, BA.2.12.1 en BA.4 of BA.5. In Panelen B en C worden medianen (zwarte balken) numeriek weergegeven en worden factorverschillen met andere subvarianten aangegeven; de gestippelde horizontale lijn geeft de ondergrens van detectie voor de test aan.

In de afgelopen maanden zijn er meerdere lijnen van de omicron (B.1.1.529) variant van het ernstige acute respiratoire syndroom coronavirus 2 (SARS-CoV-2) ontstaan,1 met subvarianten BA.1 en BA.2 die aanzienlijke ontsnapping uit neutraliserende antilichamen laten zien.2-5 Subvariant BA.2.12.1 is nu de dominante stam in de Verenigde Staten en BA.4 en BA.5 zijn dominant in Zuid-Afrika (Figuur 1A). Subvarianten BA.4 en BA.5 hebben identieke sequenties van het spike-eiwit.

We evalueerden neutraliserende antilichaamtiters tegen het referentie-WA1/2020-isolaat van SARS-CoV-2 samen met omicron-subvarianten BA.1, BA.2, BA.2.12.1 en BA.4 of BA.5 bij 27 deelnemers die waren gevaccineerd en geboost met messenger-RNA-vaccin BNT162b2 (Pfizer-BioNTech) en bij 27 deelnemers die waren geïnfecteerd met de BA.1- of BA.2-subvariant een mediaan van 29 dagen eerder (bereik, 2 tot 113) (tabellen S1 en S2 in de Aanvullende Bijlage, beschikbaar met de volledige tekst van deze brief op NEJM.org). In het vaccincohort werden deelnemers uitgesloten als ze een voorgeschiedenis hadden van SARS-CoV-2-infectie of een positief resultaat op nucleocapside-serologische analyse of als ze een ander vaccin tegen coronavirusziekte 2019 (Covid-19) of een immunosuppressief medicijn hadden gekregen.

Zes maanden na de eerste twee BNT162b2-immunisaties was de mediane neutraliserende antilichaam-pseudovirustiter 124 tegen WA1/2020, maar minder dan 20 tegen alle geteste omicron-subvarianten (Figuur 1B). Twee weken na toediening van de boosterdosis nam de mediane neutraliserende antilichaamtiter aanzienlijk toe, tot 5783 tegen het WA1/2020-isolaat, 900 tegen de BA.1-subvariant, 829 tegen de BA.2-subvariant, 410 tegen de BA.2.12.1. subvariant, en 275 tegen de BA.4 of BA.5 subvariant. Deze gegevens laten zien dat in vergelijking met de respons tegen het WA1/2020-isolaat, de neutraliserende antilichaamtiter een factor 6,4 lager was tegen BA.1, een factor 7,0 tegen BA.2, een factor 14,1 tegen BA. 2.12.1, en met een factor 21,0 tegen BA.4 of BA.5. Bovendien, vergeleken met de mediane neutraliserende antilichaamtiter tegen de BA.1-subvariant, was de mediane titer een factor 2,2 lager tegen de BA.2.12.1-subvariant en een factor 3,3 tegen de BA.4 of BA. 5 ondervariant.

Van de deelnemers die besmet waren met de BA.1- of BA.2-subvariant van omicron, waren op één na allemaal gevaccineerd tegen Covid-19. Vanwege de variatie in bemonstering na het begin van de infectie, weerspiegelen sommige monsters mogelijk niet de piekneutraliserende antilichaamtiters (tabel S2). Onder de deelnemers met een voorgeschiedenis van Covid-19 was de mediane neutraliserende antilichaamtiter 11.050 tegen het WA1/2020-isolaat, 1740 tegen de BA.1-subvariant, 1910 tegen de BA.2-subvariant, 1150 tegen de BA.2.12.1-subvariant , en 590 tegen de BA.4 of BA.5 subvariant (Figuur 1C). Deze gegevens laten zien dat in vergelijking met het WA1/2020-isolaat de mediane neutraliserende antilichaamtiter een factor 6,4 lager was tegen BA.1, een factor 5,8 tegen BA.2, een factor 9,6 tegen BA.2.12. 1, en met een factor 18,7 tegen BA.4 of BA.5. Bovendien was de mediane titer, vergeleken met de mediane titers tegen de BA.1-subvariant, een factor 1,5 lager tegen de BA.2.12.1-subvariant en een factor 2,9 tegen de BA.4- of BA.5-subvariant .

Deze gegevens laten zien dat de subvarianten BA.2.12.1, BA.4 en BA.5 substantieel ontsnappen aan neutraliserende antilichamen die worden geïnduceerd door zowel vaccinatie als infectie. Bovendien waren neutraliserende antilichaamtiters tegen de BA.4- of BA.5-subvariant en (in mindere mate) tegen de BA.2.12.1-subvariant lager dan tegen de BA.1- en BA.2-subvarianten, wat suggereert dat de SARS -CoV-2 ommicron-variant is blijven evolueren met toenemende neutralisatie-ontsnapping. Deze bevindingen bieden een immunologische context voor de huidige pieken die worden veroorzaakt door de subvarianten BA.2.12.1, BA.4 en BA.5 in populaties met hoge vaccinatiefrequenties en BA.1- of BA.2-infectie.

Nicole P. Hachmann, BS
Jessica Miller, BS
Ai-ris Y. Collier, MD
John D. Ventura, Ph.D.
Jingyou Yu, Ph.D.
Marjorie Rowe, BS
Esther A. Bond, MSN
Olivia Powers, BS
Nehalee Surve, MS
Kevin Hall, BS
Dan H. Barouch, MD, Ph.D.
Beth Israel Deaconess Medical Center, Boston, MA
[email protected]

Ondersteund door een subsidie ​​(CA260476) van de Nationale gezondheidsinstituten (NIH), door de Massachusetts Consortium voor Pathogen Readinessen door de Ragon Instituut. Dr. Barouch wordt ondersteund door de Musk Stichting. Dr. Collier wordt ondersteund door het Reproductive Scientist Development Program van de Eunice Kennedy Shriver Nationaal Instituut voor Kindergezondheid en Menselijke Ontwikkelingdoor een subsidie ​​(HD000849) van het Burroughs Wellcome Fund, en door een subsidie ​​(AI69309) van de NIH.

Door de auteurs verstrekte openbaarmakingsformulieren zijn beschikbaar met de volledige tekst van deze brief op NEJM.org.

Deze brief is op 22 juni 2022 gepubliceerd op NEJM.org.

  1. 1. Viana R, Moyo S, Amoako DG, et al. Snelle epidemische uitbreiding van de SARS-CoV-2 ommicron-variant in zuidelijk Afrika. Natuur 2022;603:679686.

  2. 2. de S, Jackson L, Khoury DS, et al. Omicron ontsnapt uitgebreid maar onvolledig aan Pfizer BNT162b2-neutralisatie. Natuur 2022;602:654656.

  3. 3. Liu L, Iketani S, Guo Yu, et al. Opvallende antilichaamontduiking gemanifesteerd door de ommicron-variant van SARS-CoV-2. Natuur 2022;602:676681.

  4. 4. Yu J, Collier AY, Rowe M, et al. Neutralisatie van de SARS-CoV-2 omicron BA.1- en BA.2-varianten. N Engl J Med 2022;386:15791580.

  5. 5. Iketani S, Liu L, Guo Yu, et al. Antilichaamontwijkingseigenschappen van SARS-CoV-2 ommicron-sublijnen. Natuur 2022;604:553556.

Leave a Comment